Introducción
Cuando prepares una página web con Jmol puedes optar por incluir algunos complementos, que en las páginas "Pop-In" aparecerán junto a la miniaplicación Jmol activa y en las páginas "ScriptButton" bajo la miniaplicación Jmol. Los complementos proporcionan al usuario de la página algún control adicional sobre el funcionamiento de la miniaplicación. Por ejemplo, uno de ellos le permite cambiar el color de fondo. Arriba se incluye la lista de complementos disponibles. Al pulsar en cada enlace, obtendrás una explicación más detallada del complemento respectivo; también puedes sencllamente seguir bajando por esta página para ver todas las descripciones. Si te interesa un complemento no disponible, puedes solicitarlo mediante una petición de prestaciones (feature request) en la sede Jmol (visita www.jmol.org, pulsa en el enlace 'Páginas del proyecto' y luego en 'Petición de prestaciones').

Control del giro
Proporciona una casilla de selección (checkbox) que controlará el giro continuado de la molécula. Al marcar la casilla comienza la rotación de la molécula; al desmarcarla, se detiene la rotación.

Botón 'Abrir consola'
Proporciona un botón que abre la consola de guiones de Jmol.

Color de fondo
Proporciona un panel emergente con una paleta de colores, en el cual el usuario puede elegir el color que quiere aplicar al fondo.

Visión en estéreo
Proporciona un menú para elegir entre los modos de estéreo:  sin estéreo, rojo/azul, rojo/cian o rojo/verde.

Controles de animación
Proporciona botones que permiten al usuario controlar la animación cuando Jmol ha cargado varios modelos: modo de animación (reproducir una vez, palíndromo o bucle), reproducir, detener, avanzar un fotograma, retroceder un fotograma.